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Nature Genetics (2023) Citare questo articolo

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Il disturbo da alimentazione incontrollata (BED) è il disturbo alimentare più comune, ma la sua architettura genetica rimane in gran parte sconosciuta. Studiare il BED è impegnativo perché è spesso in comorbilità con l’obesità, un tratto comune e altamente poligenico, ed è sottodiagnosticato nei set di dati delle biobanche. Per affrontare questa limitazione, applichiamo un approccio di apprendimento automatico supervisionato (utilizzando 822 casi di individui con diagnosi di BED) per stimare la probabilità di ciascun individuo di avere il BED sulla base delle cartelle cliniche elettroniche del Million Veteran Program. Eseguiamo uno studio di associazione sull'intero genoma di individui di origine africana (n = 77.574) ed europea (n = 285.138) controllando l'indice di massa corporea per identificare tre loci indipendenti vicino ai geni HFE, MCHR2 e LRP11 e suggerire l'APOE come rischio gene per il BED. Identifichiamo l'ereditarietà condivisa tra il BED e diversi tratti neuropsichiatrici e implichiamo il metabolismo del ferro nella fisiopatologia del BED. Nel complesso, i nostri risultati forniscono approfondimenti sulla genetica alla base del BED e suggeriscono indicazioni per la futura ricerca traslazionale.

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Le statistiche riassuntive di BED GWAS dai dati MVP sono disponibili su dbGaP (n. di accesso phs001672). Per i set di validazione esterna per l'analisi di ereditarietà partizionata, abbiamo utilizzato regioni di cromatina aperte da un modello di stimolazione del beta-estradiolo di cellule eritroidi murine (accesso GEO n. GSE114996), atlante di cromatina aperto di cervelli umani adulti (accesso GEO n. GSE147672) e atlante della cromatina degli organi umani in via di sviluppo (https://descartes.brotmanbaty.org/bbi/human-chromatin-during-development). Per le statistiche riassuntive GWAS per le analisi di correlazione genetica, consultare il progetto IEU Open GWAS (https://gwas.mrcieu.ac.uk).

Il software utilizzato in questo studio includeva i seguenti programmi: EIGENSOFT v.6 (https://github.com/dreichlab/eig); FUMA v.1.3.7 (https://fuma.ctglab.nl); GCTA v.1.93.2 (https://yanglab.westlake.edu.cn/software/gcta/#Overview); RE v.2.0 (https://www.chen.kingparentness.com); Regressione del punteggio LD v.1.0.1 (https://github.com/bulik/ldsc); liftOver v.1.2.0 (https://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgLiftOver); Minimac v.3 (https://genome.sph.umich.edu/wiki/Minimac3); Meta-analisi multi-ascendenza (https://github.com/JonJala/mama); PheMED (https://github.com/DiseaseNeuroGenomics/PheMED); PRS-CS (https://github.com/getian107/PRScs); SuSiE come implementato in echolocatoR72 (https://github.com/RajLabMSSM/echolocatoR).

Mitchell, KS et al. Disturbo da alimentazione incontrollata: un'indagine a livello di sintomo delle influenze genetiche e ambientali sulla responsabilità. Psicologo. Med. 40, 1899–1906 (2010).

Articolo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Reichborn-Kjennerud, T., Bulik, CM, Tambs, K. & Harris, JR Influenze genetiche e ambientali sull'alimentazione incontrollata in assenza di comportamenti compensatori: uno studio sui gemelli basato sulla popolazione. interno J. Mangia. Disordine. 36, 307–314 (2004).

Articolo PubMed Google Scholar

Udo, T. & Grilo, CM Prevalenza e correlati dei disturbi alimentari definiti dal DSM-5 in un campione rappresentativo a livello nazionale di adulti statunitensi. Biol. Psichiatria 84, 345–354 (2018).

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